政治腐败与中央集权的过度
元朝自称为“大元”之国，其政治体系以严密的中央集权为特点。明升暗降、贵族化、官僚体系臃肿等问题导致了政府效率低下，行政管理不善。这种体制虽然在征服汉人地区时有助于迅速建立统治，但长期下去却难以为继。随着时间的推移，地方官员对中央失去了信任，而皇帝则越来越依赖宦官和外来的军阀，这种情况进一步加剧了政治腐败。
经济结构的不稳定性
元朝初期经济繁荣，尤其是丝绸贸易和马匹生产。但随着时间推移，该经济结构逐渐出现问题。在农业方面，由于土地兼并严重以及耕作技术落后，使得农民生活条件恶化，大量逃荒或起义反抗。这一情况引发了社会矛盾激化，同时也影响到了国家税收基础，从而削弱了政府财政。
农业危机与粮食供应短缺
元朝末年，因连年自然灾害如旱灾、洪水频发，加上农业生产力不足，再加上人口压力的增加，导致粮食产量减少。而由于交通网络受阻，不利于物资运输，因此粮食供应变得紧张。这直接影响到人民生活水平，并且使得政府面临更大的挑战去维持社会秩序。
外患与边疆防御困境
元朝在北方有强大的蒙古骑兵，但同时也面临来自西方（即察哈尔部）和东南（即明军）的威胁。此外，在中亚边疆，对突厥人的控制并不牢固，这些都成为元朝防御上的巨大负担。当这些力量相互作用时，便形成了一系列复杂的问题，为元朝带来了极大的挑战。
文化冲突与民族政策失当
元代采取了一些试图融合多个民族文化的措施，如设立书院传播儒学，并鼓励各地文化交流。但这并没有解决根本问题，即不同民族之间存在深刻的人文关怀差距。尽管一些高级知识分子尝试将蒙古人教育成儒家士人，但实际效果有限。此外，对待其他民族的手段往往是武力镇压或者是隔离主义，这种政策造成了更多社会矛盾，进而加剧了内部冲突。
社会动荡与民变四起
在内忧外患的情况下，一系列农民起义爆发，其中最著名的是红巾军起义，它们要求土地改革、结束封建制度及提高人民生活水平等诉求，与元政府所代表的一切都不谋而合。这一浪潮席卷全局，最终促成了1368年的明太祖朱元璋夺取政权，是中国历史上著名的一次革命转折点之一。
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