张格尔，浩罕王国的儿子，其祖父布拉呢敦与乾隆皇帝对立，最终被乾隆灭族。张格尔的父亲萨木克逃到浩罕，清政府每年给予一万两白银让浩罕国王监视他。萨木克在浩罕生下三子，次子就是张格尔。张格尔野心勃勃，以诵经祈福传食部落。他接受英国人的顾问、训练和武器，在英国控制下的阿富汗首都喀布尔留学，为恢复和卓家族统治而努力。
从嘉庆二十五年开始，张格尔一直在新疆南疆发动叛乱直到1831年。在浩罕支持下，他潜入南疆，并利用南疆各族人民的反清情绪和宗教影响集众万余人发动叛乱。他自称赛义德·张格尔苏丹，复辟了和卓封建统治。清政府调集军队会师于阿克苏，最终收复了喀什噶尔等城。在道光八年初，被捕并处死。
1817年，浩罕汗提出要求在喀什噶尔享受贸易特权，但被拒绝。此后，一位名为萨木斯卡的代表出现在喀什噶尔回答提议，而这导致了新的冲突。1824年至1830年的间隙中，多次有小规模战斗发生，其中包括一次大规模叛乱。这场叛乱是由一支由柯勒克孜人组成的数百人军队引起，他们试图恢复六城地区的旧时统治。
1825年的事件导致了一场更大的战役，其中涉及到了两千名柯勒克孜骑兵围困清军，并最终击败他们。这使得周围地区的人们意识到了中国人已经非常不受欢迎，这促使和卓召集超过五百人的军队进行攻势，并且成功地扩大了他的力量，使得双方都损失了大量人员。
随着时间推移，该战争变得越来越激烈，最终导致了十个星期内四百名东干士兵或信仰伊斯兰教的人民团体遭遇失败并被俘虏。而当局最终将此视为一个警示，不再继续对抗此类行动，从而结束了这一系列事件。
